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            1. 15522676233
              TECHNICAL ARTICLES

              技術(shù)文章

              當(dāng)前位置:首頁技術(shù)文章目標(biāo)區(qū)域高通量測(cè)序服務(wù)

              目標(biāo)區(qū)域高通量測(cè)序服務(wù)

              更新時(shí)間:2019-02-19點(diǎn)擊次數(shù):3103

              目標(biāo)區(qū)域高通量測(cè)序介紹

              目標(biāo)區(qū)域高通量測(cè)序是一種高度特異和靶向的方法,是指采用各種技術(shù)手段將待檢測(cè)的目標(biāo)區(qū)域富集之后,進(jìn)行高通量測(cè)序的研究策略。目標(biāo)區(qū)域的高深度測(cè)序可以有效識(shí)別基因的變異并對(duì)其進(jìn)行特征譜分析,通常用于分析特定基因組區(qū)域中的DNA變異,尤其是腫瘤的基因組研究。

              目標(biāo)區(qū)域高通量測(cè)序的策略與區(qū)別

               

              液相雜交捕獲

              擴(kuò)增子測(cè)序

              富集策略

              探針雜交

              多重PCR

              適用范圍

              100k<目標(biāo)區(qū)域<100M

              目標(biāo)區(qū)域<100k

              檢測(cè)變異類型

              SNP、大片段Indels、融合基因、基因擴(kuò)增等。

              SNP、小片段Indels、基因擴(kuò)增等

              核酸起始量

              100-200ng

              50-100ng

              優(yōu)勢(shì)

              發(fā)現(xiàn)新的SNP、融合基因、大片段Indels等

              常用于發(fā)現(xiàn)低頻突變(低于0.1%),可用于ctDNA的研究

              制約因素

              探針捕獲效率

              panel擴(kuò)增均一性

              擴(kuò)增子測(cè)序
              原理:通過設(shè)計(jì)目標(biāo)基因組區(qū)域的引物,經(jīng)多重PCR反應(yīng)擴(kuò)增將目標(biāo)區(qū)域DNA富集純化后,進(jìn)行高通量測(cè)序和數(shù)據(jù)分析。通常用于擴(kuò)增區(qū)域較小(<100k)的情況。

              技術(shù)流程

              技術(shù)優(yōu)勢(shì)

              目標(biāo)區(qū)域小,測(cè)序成本較低,測(cè)序深度通常可高達(dá)10000X(常規(guī)全外顯子組測(cè)序?yàn)?00X),因此可以發(fā)現(xiàn)低頻的突變。

              可選panel:包括現(xiàn)成產(chǎn)品(適合不同腫瘤的基因組合)和個(gè)性化定制兩種

              Panel類型

              50 gene

              BRCA1/2

              定制

              適用腫瘤

              所有腫瘤

              乳腺癌

              覆蓋基因組

               

              覆蓋區(qū)域

              熱點(diǎn)突變區(qū)

              全外顯子區(qū)

              擴(kuò)增子數(shù)目

              207

              148

              Panel大小

              40K

              17K

               

              panel名稱

              適合腫瘤

              適用樣本

              應(yīng)用

              50 gene panel

              (可定制)

              所有腫瘤

              FFPE

              從腫瘤組織切片中檢出腫瘤特異性低頻突變,可以應(yīng)用于腫瘤患者的靶向用藥指導(dǎo)、晚期患者的監(jiān)測(cè)、個(gè)體化治療的療效評(píng)估等。

              血漿(ctDNA)

              從ctDNA檢出腫瘤特異性低頻突變,可以應(yīng)用于腫瘤的超早期篩查、腫瘤患者的靶向用藥指導(dǎo)、晚期患者的監(jiān)測(cè)、個(gè)體化治療的療效評(píng)估等。

              BRCA1/2 panel

              乳腺癌

              全血

              檢測(cè)乳腺癌BRCA1/2易感基因上存在的致癌熱點(diǎn)突變。

               

              樣品要求
              1、樣品純度要求:OD值應(yīng)在1.82.0之間;電泳檢測(cè)無明顯非特異性雜帶,PCR產(chǎn)物條帶清晰、完整。
              2、樣品濃度:純化后PCR產(chǎn)物濃度不低于5 ng/ul。
              3、樣品總量:樣品總量不低于200ng。
              4、樣品信息:請(qǐng)?zhí)峁〥NA樣品具體濃度、體積、制備時(shí)間、溶劑名稱及物種來源。請(qǐng)同時(shí)附上QC數(shù)據(jù),包括電泳膠圖、分光光度或Nanodrop儀器檢測(cè)數(shù)據(jù)。
              服務(wù)流程
              1、提交項(xiàng)目課題相關(guān)需求和資料。
              2、與我們的專業(yè)技術(shù)團(tuán)隊(duì)討論項(xiàng)目細(xì)節(jié)。
              3、根據(jù)討論后的意見對(duì)實(shí)驗(yàn)方案進(jìn)行修改。
              4、雙方均滿意并達(dá)成一致,簽訂技術(shù)服務(wù)合同。
              5、開展實(shí)驗(yàn),按期完成合同規(guī)定的內(nèi)容。
              6、結(jié)題,提供實(shí)驗(yàn)原始結(jié)果和分析結(jié)果、實(shí)驗(yàn)流程、實(shí)驗(yàn)條件等等。
              我們的優(yōu)勢(shì)
              1、游離DNA純化技術(shù)能有效去除基因組DNA污染,使定量更準(zhǔn)確。
              2、擴(kuò)增子生成技術(shù)提高了擴(kuò)增子生成的均一性,降低測(cè)序成本。
              3、低頻突變生物分析技術(shù)能有效在背景中檢出相關(guān)低頻突變。
              4、為了克服PCR擴(kuò)增中引入的人源誤差,在進(jìn)行任何擴(kuò)增之前加入U(xiǎn)MIs(unique molecular indices),從而保留起始DNA分子的wei一性并克服PCR擴(kuò)增帶來的假陽性問題,以及文庫構(gòu)建過程中引入的偏差。
              咨詢與訂購(gòu) 
              感謝您選擇我們的服務(wù),如果您有任何問題,請(qǐng)聯(lián)系我們,我們將竭誠(chéng)為您解答和服務(wù)。 
               

               

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